死のウイルスに冒されたニューヨークで、生き長らえた１２人の子供たち。疾病対策の鍵を求める感染症研究所の学者たちはドイツ軍と自衛隊の手を借りてようやく子供たちを確保した。しかし大捜索劇が生んだ思わぬ風評のせいで、子供たちの１人が何者かにさらわれる。奪還命令をおびた陸自特殊部隊はニューヨークの地下深くに誘い込まれるが!?――一方、テキサスでは西から勢力を伸ばすカリフォルニア軍団を迎え撃つべく、合衆国正規軍が戦力を結集。大規模衝突が目前に迫る!!　ウイルスばかりか同胞までを敵とする米国に未来はあるのか？