数奇な運命をたどり、故郷を追われて漁師となっていた影山彦十郎は、あるとき江戸に呼び戻され、奉行直轄の闇の処刑人としての任務につく。
まさに世は維新前夜。桜田門外の大老暗殺により攘夷の動きが活発化するなか、彦十郎はたび重なる異人殺傷事件の阻止を命じられる。このまま外国人が殺されていけば、それに乗じて各国が軍を駐屯させ、日本を軍事的に乗っ取ってしまう恐れがあったのだ。
万延二年、八州廻りや元遊女・お蓮の助けを借り、ハリス襲撃を未然に防いだ彦十郎は、さらに徳川斉篤なる過激派の抹殺を命じられる。
そしてその裏には、かつて恩を受けた旧知の人物の存在が見えてくるのだが……。風雲急を告げるシリーズ第三弾！