死を呼ぶ裏切り！！犠牲となるのは、あの男……！－－東京で行われる各国首脳によるサミット会場に、不審者が侵入。彼らは各国首脳とその家族を人質にとるが、これを裏で糸を引いていたのは、この国の総理である九条正宗（くじょう・まさむね）だった。テロリストと、総理が相手と知らず、テロを食い止めようと動く「THIRD-i（サードアイ）」。その陰で藤丸（ふじまる）と『J』は、人質の解放と九条の正体を曝く計画を進めるが……。