過酷な宿命を背負いながらも、「仮面ライダーBlack」として生きる事を決意した南光太郎。だが、「ゴルゴムの子」として選ばれて誕生した光太郎を連れ戻そうと、怪人たちの追手が続々とかかる。一方、世界を破壊し新世界を創造するというゴルゴムの野望が世界中で進行。沖縄・那覇米軍基地より水爆投下指令発令。投下目標は…東京！？　ギリシャ・アテネでは集団行方不明事件が…！　光太郎は苦悩しながらも悪と戦う…！！